Научная работа кафедры развивается в настоящее время по двум основным направлениям:
1. Расчеты и прогнозы гидрологического режима, качества вод и русловых процессов рек Сибири – руководители Д.А. Бураков, В.А. Земцов.
По этому направлению под руководством Д.А. Буракова разрабатывается новое поколение методов прогноза стока и уровней воды во время половодья с использованием наземной и космической информации.
Развиваются исследования по созданию основы для управления и охраны водных ресурсов территории: моделированию, расчету и прогнозу переноса и трансформации загрязнений в русловой сети речных бассейнов, изучению географических закономерностей формирования качества поверхностных вод Сибири, взаимодействия поверхностных и подземных вод, закономерностей динамики потоков и русловых деформаций рек в естественном состоянии и под влиянием хозяйственной деятельности, режима Васюганского болота.
В последнее время сотрудники кафедры (А.И. Петров) участвовали в оценке ресурсов и режима вод Хакасии.
2. Водно-ледовый баланс и эволюция оледенения в горах юга Сибири (в современном, ретроспективном и прогнозном вариантах) – совместно с ПНИЛ гляциоклиматологии, руководитель Ю.К. Нарожный.
Целью исследований является создание детальной схемы позднеголоценовой эволюции оледенения в горах Южной Сибири, оценка роли снежно-ледовых ресурсов в гидрологическом цикле, выявление тенденций режимных и динамических характеристик ледников и прогноз их изменений. Можно утверждать, что Алтай является ключевым районом для изучения режима оледенения всей Сибири, а, возможно, и всего Азиатского сектора горного оледенения. Поэтому результаты работ являются составной частью банка данных Всемирной службы мониторинга ледников, созданной в Цюрихе под эгидой ЮНЕСКО для глобальных обобщений по колебаниям ледников горных стран.
В дальнейшем эти исследования будут продолжены и сосредоточены на решении как фундаментальных проблем формирования и динамики водных ресурсов (нивально–гляциальных и речных систем, болотных комплексов), так и вопросов мониторинга и управления водными ресурсами (с учетом режима и качества поверхностных вод) в целях их рационального использования и охраны.
В 2006-2007 гг. по программе «Инновационный университет» выполняются темы:
«Обоснование концепции компьютерного моделирования режима рек для рационального использования и охраны водных ресурсов» (2006) и
«Создание системы компьютерного моделирования речного стока и русловых процессов рек на базе современного гидрометрического оборудования и программного обеспечения для поддержки принятия решений в области рационального использования и охраны водных ресурсов» (2007).